1940年代に入ると、まずは40年に、史上4度目のタイトルを勝ち取った。チームの主力となったのは Jaime Sarlanga であった。続く1943年、、30試合18勝3敗9分で、40年代2度目のタイトルを勝ち取った。当時主力として活躍した顔ぶれには、Natalio Pescia、Mario Boye、Severino varela、そして40年の優勝の主力選手の Salamga などがいた。

そして Boca Juniors が6度目のタイトルを勝ち取るまで時間はかからなかった。1944年、前年とほぼ同じメンバーだった。その後タイトルを勝ち取ったのは10年後の1954年。この年の戦績は、30試合21勝6敗3分。Natalio Pescia が、44年の優勝に引続き、チームの主力選手として活躍した。

リーグでは、1970年に70年代最初の優勝を果たした。22試合15勝4敗3分、40得点、21失点。主力選手は、 Roma、Rojas、Marzolini、Mouzo、Sune、Madurg らが活躍した。その後1976年、 Nacional と metropolitano で優勝を成し遂げる。 metropolitan リーグは11試合8勝3分18得点8失点。決勝でリーベルに chapa Sune がゴールを決め、1-0で勝利。同リーグとも、ほぼ同メンバーで参戦した。しかし Nacional リーグの優勝は、 Mario Zanabria の活躍がなければ有り得なかったであろう。

そして1977年9月14日、Boca Juniors 史上初、レベルタドーレス杯を勝ち取った。決勝の相手は Crzeiro で、第一戦1-0でボカが勝利、第二戦は敵地ブラジルで1-0と敗戦、第三戦の会場となったのはウルグアイの Centenario de Montevideo 。試合は引分けのままPK戦の末、5-4で Boca Juniors が、この大会初優勝を成し遂げる。続く78年のレベルタドーレス杯。相手は Deportivo Cali (コロンビア) 。第一戦は不利な敵地で0-0で引分け。そしてホームに迎えた第二戦、ボンボネーラで4-0で Boca Juniors が快勝。この大会、二連覇の快挙を達成する。同年、 intercontinental (現トヨタカップ) 決勝では、ボンボネーラで Borussia Monchengladbach に3-0で勝利を収め、intercontinental 初優勝を成し遂げた。

リーグ優勝は81年の Metropolitano のみであり、その年の戦績は、34試合20勝4敗10分、60得点、27失点。勝点50は、2位の Ferro と、その差はわずか1点であった。主力選手は、 Maradona、Brindisi、Ruggerl、Gatti、Mouzo 。

その後優勝から遠ざかるが、1989年のスーパーコパ決勝、対インデペンディエンテ戦第二戦、0-0の引分けのままPK戦へもつれ込んだ末、インデペンディエンテを下し、 Boca Juniors 史上、国際大会4度目のタイトルを手に入れた。この大会の主力選手には Navarro Montoya、Claudio Marangoni、latorre などがいた。